病原体基因测序
疾病概述 病原体(pathogens):是指可造成人或动植物感染疾病的微生物(包括细菌、病毒、立克次氏体、真菌)、寄生虫或其他媒介(微生物重组体包括杂交体或突变体)。每个人一生中可能受到150种以上的病原体感染。 感染:是指病原体侵入人体所引起的局部组织和全身性炎症反应。及时准确的检出相关病原体及耐药基因,可为临床合理使用抗生素提供依据,是阻止病情进一步发展的有利控制措施。 tNGS技术介绍 靶向测序(Targeted-NGS,tNGS)通过降低检测目标病原体数量重点聚焦临床常见病原体,并通过特异性扩增排除人源核酸片段对检测灵敏度的影响,使得tNGS病原体检测更贴合临床常见病原体种类相对固定、敏感性特异性要求高、检测成本控制要求高的实际需求。 tNGS优势 1、快:无需培养,最快1天出报告 2、全:临床常见病原体高覆盖,另增耐药基因、毒力基因;可检测拷贝量评估病原负荷,判断感染严重度。 3、准:超多重PCR靶向扩增,病原微生物靶向诊断受宿主与样本干扰小,高灵敏、低污染; 4、省:聚焦临床常见病原体,控制临床成本 mNGS技术介绍 宏基因组测序(meta-NGS,mNGS)是一种无需培养、无需预设、无偏好性,直接提取临床样本中DNA/RNA,采用高通量测序技术,一次性完成细菌、真菌、病毒和寄生虫等三万多种病原体检测。 mNGS优势 1、比传统检测方法快——16到36小时出具报告 2、覆盖病原体全面——常见、罕见、新发病原体一网打尽 3、特异度高、灵敏度高 4、众多专家指南共识推荐 5、可以检出多种病原体感染 |